Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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TUBB3Q13509 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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TUBB3Q13509 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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TUBB3Q13509 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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TUBB3Q13509 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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