Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
XRCC4Q13426 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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