Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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CDO1Q16878 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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CDO1Q16878 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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