Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms