Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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TCOF1Q13428 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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