Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP4Q13107 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP4Q13107 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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