Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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