Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HIF1AQ16665 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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