Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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