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| BECN1 | Q14457 | RN7SKP263-201 | ENST00000411194 | 309 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | USP9YP33-201 | ENST00000412220 | 421 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC006369.2-201 | ENST00000431712 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AL445264.1-201 | ENST00000621719 | 171 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC023510.2-201 | ENST00000622162 | 746 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | TTN-AS1-267 | ENST00000628826 | 662 nt | TSL 5 BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | MUC7-202 | ENST00000413702 | 2540 nt | APPRIS P2 TSL 4 BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | BCLAF3-202 | ENST00000379682 | 3217 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | RABGAP1L-203 | ENST00000347255 | 1744 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | MACC1-205 | ENST00000589011 | 2686 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | PP2D1-202 | ENST00000389050 | 2151 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | RMDN2-205 | ENST00000407257 | 2280 nt | TSL 5 BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC005183.1-201 | ENST00000603687 | 1979 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNA5SP479-201 | ENST00000364858 | 117 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR591-201 | ENST00000385290 | 95 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU2-47P-201 | ENST00000410649 | 186 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | CCDC58P2-201 | ENST00000417131 | 366 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | RPL21P32-201 | ENST00000419877 | 477 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | MTCO1P39-201 | ENST00000426148 | 480 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | CYCSP4-201 | ENST00000429682 | 331 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | SETP5-201 | ENST00000437270 | 562 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | MTCYBP34-201 | ENST00000439552 | 670 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | RPS29P7-201 | ENST00000439662 | 171 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | C1orf185-202 | ENST00000467127 | 747 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | RPS27AP1-201 | ENST00000475545 | 471 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC104563.1-201 | ENST00000476147 | 376 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC012181.1-201 | ENST00000479895 | 423 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
| BECN1 | Q14457 | LINC02241-202 | ENST00000512688 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC078880.1-201 | ENST00000546696 | 553 nt | TSL 4 BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BECN1 | Q14457 | LINC01905-202 | ENST00000588139 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC022916.3-201 | ENST00000592961 | 742 nt | BASIC | 3.86 | □□□□□ -1.79 | | |