Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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