Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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