Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms