Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL434P-201ENST00000495872 271 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GNAS-AS1_5.1-201ENST00000614281 121 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL031229.1-201ENST00000404273 224 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL590648.3-201ENST00000446962 473 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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