Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms