Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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