Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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