Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CRXO43186 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CRXO43186 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CRXO43186 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.4 ms