Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms