Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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