Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL24A1Q17RW2 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms