Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms