Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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