Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms