Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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