Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATRQ13535 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATRQ13535 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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