Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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