Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms