Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SPTAN1Q13813 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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