Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms