Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms