Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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