Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
APOFQ13790 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
APOFQ13790 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
APOFQ13790 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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