Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms