Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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PTPRAP18433 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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