Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CRXO43186 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CRXO43186 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CRXO43186 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms