Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms