Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TNXAQ16473 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNXAQ16473 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms