Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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