Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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