Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE4CQ08493 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms