Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms