Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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