Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
J3KRW8 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
J3KRW8 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
J3KRW8 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
J3KRW8 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
J3KRW8 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
J3KRW8 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
J3KRW8 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
J3KRW8 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
J3KRW8 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
J3KRW8 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms