Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms