Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms