Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms