Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vamp5Q9Z2P8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vamp5Q9Z2P8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms