Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms