Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms